Cuanto crece cuando se empalma

Procariotas con splicing alternativo

A pesar de la importancia de TEP1/PTEN en los hongos, sólo hay unos pocos informes sobre la función y la regulación de sus homólogos en los hongos filamentosos. En esta investigación, analizamos biológicamente el gen similar a PTEN mediante la creación de varias cepas mutantes en el hongo de la explosión del arroz M. oryzae. Los datos biológicos y moleculares revelan que un empalme alternativo de MoPTEN es importante para el crecimiento, el desarrollo y la patogénesis en M. oryzae.

Se utilizaron las cepas Saccharomyces cerevisiae BY4743 y la cepa mutante de deleción TEP1/PTEN (Invitrogen, Beijing, China) para el ensayo de complementación funcional. El inhibidor de PI3K wortmannin (KY12420, Sigma, Pekín, China) se preparó en dimetilsulfóxido (DMSO) como solución madre (25 mg/mL) y se almacenó a -20°C. La transformación de la levadura S. cerevisiae se realizó por el procedimiento del acetato de litio. Para la expresión del gen de la levadura, se utilizó el promotor YPB-ADHpt y las regiones terminadoras del gen ADH1 en YPB1 (Bertram et al., 1996). Todas las cepas de levadura se cultivaron según Li et al. (2018).

Empalme alternativo pdf

El splicing alternativo, o splicing de ARN alternativo, o splicing diferencial, es un proceso de splicing alternativo durante la expresión de un gen que permite que un único gen codifique múltiples proteínas. En este proceso, determinados exones de un gen pueden incluirse o excluirse del ARN mensajero (ARNm) final y procesado que se produce a partir de ese gen[1], lo que significa que los exones se unen en diferentes combinaciones, dando lugar a diferentes cadenas (alternativas) de ARNm. En consecuencia, las proteínas traducidas a partir de ARNm empalmados alternativamente contendrán diferencias en su secuencia de aminoácidos y, a menudo, en sus funciones biológicas (véase la figura). En particular, el splicing alternativo permite al genoma humano dirigir la síntesis de muchas más proteínas de las que cabría esperar de sus 20.000 genes codificadores de proteínas.

El splicing alternativo es un fenómeno normal en los eucariotas, donde aumenta enormemente la biodiversidad de proteínas que puede codificar el genoma;[1] en los seres humanos, el ~95% de los genes multiexónicos están empalmados de forma alternativa[2] Se observan numerosos modos de splicing alternativo, de los cuales el más común es la omisión de exón. En este modo, un exón concreto puede incluirse en los ARNm en algunas condiciones o en determinados tejidos, y omitirse del ARNm en otros[1].

Tipos de empalme alternativo

La plataforma de creación musical Splice está valorada en casi 500 millones de dólares esta semana, tras una inversión de 55 millones de dólares de Goldman Sachs, así como de una firma de inversión llamada Music, según un informe de Bloomberg, la última afirmación para el floreciente ecosistema musical del bricolaje.

Steve Martocci, cofundador de GroupMe, fundó Splice en 2013 como medio para facilitar la creación de música y encontró una base hambrienta de músicos sin apoyo de los sellos musicales. Sus muestras y bucles, más fácilmente disponibles para los usuarios de Splice por una cuota mensual en lugar de mediante el pago de derechos al creador original de la muestra, son un gran atractivo para el servicio. “Cuando empezamos, la gente decía: ‘No hay manera de que te dé mis muestras. ¿Por qué iba a dar mi salsa secreta?”. Martocci explicó anteriormente a Rolling Stone cómo conseguir que los productores pongan su música en la plataforma.

La reciente financiación y la alta valoración de Splice subrayan la magnitud de la música que se ha hecho en la era del streaming. En 2019, Spotify añadía 40.000 canciones a la plataforma cada día. Gran parte de esa música procede de artistas independientes que carecen de fondos para grabarla en un estudio y son los que más se benefician de las muestras baratas y las herramientas de producción caseras.

Empalme alternativo en eucariotas

La mayoría de los genes de las plantas están interrumpidos por intrones y los correspondientes transcritos necesitan someterse al splicing del pre-ARNm para eliminar estas secuencias intermedias. El splicing alternativo (AS) es un importante proceso postranscripcional que crea múltiples variantes de ARNm a partir de una única molécula de pre-ARNm, aumentando así el potencial codificador y regulador de los genomas. En las plantas, este mecanismo ha sido implicado en la respuesta a las señales ambientales, incluyendo el estrés abiótico y biótico, en la regulación de procesos de desarrollo clave como la floración, y en el mantenimiento del tiempo circadiano. Los primeros pasos del desarrollo de la planta -desde la formación del embrión y la germinación de la semilla hasta la skoto y la fotomorfogénesis- son críticos tanto para ejecutar el plan corporal correcto como para iniciar un nuevo ciclo reproductivo. Aquí revisamos la evidencia disponible sobre la participación de AS y varios factores de empalme en las etapas iniciales del desarrollo de las plantas, al tiempo que destacamos los hallazgos recientes así como los posibles retos futuros.

Dos estudios recientes abordan la contribución de AS durante la germinación de las semillas. En los embriones de cebada, el 14-20% de los genes multiexón expresaron múltiples isoformas de ARNm, algunas de las cuales mostraron claros cambios durante la germinación temprana (Zhang et al., 2016). Sorprendentemente, el evento AS más prominente fue la selección alternativa 3′SS, y no hubo alteraciones sustanciales en los niveles totales de transcripción para la mayoría de los genes. La evaluación de las funciones biológicas de los genes sometidos a AS durante la germinación indicó la participación en la síntesis de proteínas, el metabolismo energético y del carbono, así como el transporte y el empalme del ARN. En general, la germinación de las semillas parece requerir la expresión de un conjunto específico de genes, en el que el AS desempeña un papel generalizado. El potencial regulador de AS durante la germinación se ve subrayado por un informe posterior en arabidopsis (Narsai et al., 2017) que confirma la expresión de variantes de ARNm específicas de tiempo y tejido, la ocurrencia de cambios dinámicos en la abundancia de isoformas, y que los reguladores de empalme son objetivos importantes de AS durante este proceso de desarrollo.